Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf1cQ6PDZ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1cQ6PDZ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms