Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Herc4Q6PAV2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herc4Q6PAV2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms