Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp49Q6P9L4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp49Q6P9L4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms