Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BC061212Q6P8K3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BC061212Q6P8K3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms