Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn7Q6P5G6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ubxn7Q6P5G6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn7Q6P5G6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms