Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga2Q6P5E6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga2Q6P5E6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga2Q6P5E6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms