Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf1Q6P542 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf1Q6P542 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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