Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Podnl1Q6P3Y9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Podnl1Q6P3Y9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms