Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga3Q6NZL0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Soga3Q6NZL0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Soga3Q6NZL0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms