Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1Q6NXH3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms