Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HelbQ6NVF4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HelbQ6NVF4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HelbQ6NVF4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms