Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc66Q6NS45 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc66Q6NS45 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms