Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mvb12bQ6KAU4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mvb12bQ6KAU4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms