Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf8Q6DID3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms