Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca2Q6DIC0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Smarca2Q6DIC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Smarca2Q6DIC0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca2Q6DIC0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca2Q6DIC0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms