Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbf1Q6DFZ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms