Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltn1Q6A009 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms