Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdzrn3Q69ZS0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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