Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgefl1Q68EF8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgefl1Q68EF8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rapgefl1Q68EF8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms