Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3ipQ68EF0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms