Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlrp9bQ66X22 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp9bQ66X22 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp9bQ66X22 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp9bQ66X22 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp9bQ66X22 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp9bQ66X22 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp9bQ66X22 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp9bQ66X22 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp9bQ66X22 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms