Protein–RNA interactions for Protein: Q66X03

Nlrp9a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9aQ66X03 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp9aQ66X03 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9aQ66X03 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms