Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ino80dQ66JY2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ino80dQ66JY2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms