Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8eQ66JT1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms