Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist2h2beQ64524 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2beQ64524 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2beQ64524 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2beQ64524 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist2h2beQ64524 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms