Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gja3Q64448 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja3Q64448 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms