Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ifit1Q64282 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifit1Q64282 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms