Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim24Q64127 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim24Q64127 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms