Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pan3Q640Q5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms