Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PatjQ63ZW7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PatjQ63ZW7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 320.1 ms