Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CochQ62507 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CochQ62507 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CochQ62507 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CochQ62507 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CochQ62507 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CochQ62507 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CochQ62507 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CochQ62507 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CochQ62507 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CochQ62507 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CochQ62507 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CochQ62507 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CochQ62507 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CochQ62507 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CochQ62507 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CochQ62507 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CochQ62507 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CochQ62507 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CochQ62507 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CochQ62507 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CochQ62507 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CochQ62507 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CochQ62507 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CochQ62507 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CochQ62507 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CochQ62507 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CochQ62507 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CochQ62507 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CochQ62507 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CochQ62507 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CochQ62507 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CochQ62507 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CochQ62507 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CochQ62507 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CochQ62507 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CochQ62507 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CochQ62507 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CochQ62507 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CochQ62507 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CochQ62507 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CochQ62507 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CochQ62507 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CochQ62507 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CochQ62507 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CochQ62507 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CochQ62507 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CochQ62507 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CochQ62507 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CochQ62507 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CochQ62507 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CochQ62507 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CochQ62507 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CochQ62507 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CochQ62507 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CochQ62507 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CochQ62507 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CochQ62507 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CochQ62507 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CochQ62507 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms