Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga3Q62470 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga3Q62470 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms