Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vil1Q62468 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms