Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3gl2Q62420 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Sh3gl2Q62420 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Sh3gl2Q62420 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Sh3gl2Q62420 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Sh3gl2Q62420 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Sh3gl2Q62420 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Sh3gl2Q62420 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3gl2Q62420 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3gl2Q62420 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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