Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms