Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff3Q62395 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms