Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim28Q62318 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trim28Q62318 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim28Q62318 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim28Q62318 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim28Q62318 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim28Q62318 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim28Q62318 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim28Q62318 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim28Q62318 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms