Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sall3Q62255 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sall3Q62255 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms