Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Kdm5dQ62240 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Kdm5dQ62240 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Kdm5dQ62240 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Kdm5dQ62240 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Kdm5dQ62240 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Kdm5dQ62240 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms