Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema5aQ62217 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms