Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp1Q62209 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp1Q62209 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms