Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema3cQ62181 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema3cQ62181 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms