Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctr9Q62018 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctr9Q62018 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms