Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrc1Q61830 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mrc1Q61830 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrc1Q61830 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms