Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LbpQ61805 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LbpQ61805 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LbpQ61805 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LbpQ61805 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LbpQ61805 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LbpQ61805 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LbpQ61805 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LbpQ61805 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LbpQ61805 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LbpQ61805 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LbpQ61805 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LbpQ61805 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LbpQ61805 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LbpQ61805 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LbpQ61805 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LbpQ61805 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LbpQ61805 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms