Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga7Q61738 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Itga7Q61738 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms