Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd47Q61735 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd47Q61735 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms