Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AtrxQ61687 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms