Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacsin1Q61644 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pacsin1Q61644 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms