Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm1Q61508 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms